Книга "Tutorials in Chemoinformatics" содержит более 30 учебных пособий и более 100 упражнений в области хемоинформатики, поддерживаемых онлайн-программным обеспечением и наборами данных. Хемоинформатика широко используется в научных и промышленных исследованиях в области химии и биохимии по всему миру. Однако до появления этого уникального руководства не было книг, предлагающих практические упражнения в методах хемоинформатики. "Tutorials in Chemoinformatics" содержит более 100 упражнений в 30 учебных пособиях, исследующих ключевые темы и методы в этой области. Книга имеет прикладной подход к предмету с сильным акцентом на решении задач и вычислительных методологиях. Каждое учебное пособие является автономным и содержит упражнения для студентов, которые могут выполнять с использованием различных программных пакетов. Большинство учебных пособий разделены на три раздела, посвященные теоретическому фону, описанию алгоритмов и программным приложениям соответственно, последний раздел предоставляет пошаговые инструкции по использованию программного обеспечения. На протяжении всей книги используются три типа программных инструментов: внутренние программы, разработанные авторами, программы с открытым исходным кодом и коммерческие программы, которые доступны бесплатно или по небольшой стоимости для ученых. Внутреннее программное обеспечение и наборы данных доступны на специальном сайте-компаньоне. Ключевые темы и методы, рассмотренные в "Tutorials in Chemoinformatics", включают кураторство и стандартизацию данных, разработку и использование химических баз данных, кодирование структуры молекул с помощью молекулярных дескрипторов, текстовых строк и бинарных отпечатков, проектирование разнообразных и сфокусированных библиотек, анализ и визуализацию химических данных, моделирование свойств/активности структуры (QSAR/QSPR), подходы ансамблевого моделирования, включая "bagging", "boosting", "stacking" и "random subspaces", моделирование 3D-фармакофоров и фармакологический анализ с использованием анализа формы, докинг белок-лиганд и реализацию алгоритмов на языке программирования высокого уровня. "Tutorials in Chemoinformatics" является идеальным дополнительным учебным пособием для продвинутых курсов бакалавриата и магистратуры по хемоинформатике, биоинформатике, вычислительной химии, вычислительной биологии, медицинской химии и биохимии. Она также является ценным ресурсом для медицинских химиков, научных исследователей и промышленных химиков, желающих улучшить свои навыки в области хемоинформатики.
Эта книга предлагает 30 практических руководств и более 100 упражнений по кемоинформатике в поддержку онлайн-программного обеспечения и наборов данных. Да, кемоинформатика широко используется как в академических, так и в промышленных исследованиях в области химической и биохимической науки по всему миру. Однако до этого уникального пособия не было книг, предлагающих практические занятия по методам кемоинформаттеки. В этой книге мы предлагаем больше, чем 100 пошаговых практических заданий на ключевые темы и методы в кемоинформатеке, практикующих системный подход к предмету с акцентом на решение проблем методами вычислительной химии. Каждое руководство содержит инструкции для студентов по выполнению заданий, используя разнообразные программы. Большинство руководств разделено на три раздела: теоретическая база, описание алгоритмов и применение программ, а также дают пошаговые инструкции по использованию программы. Мы используем три типа программного обеспечения: собственная разработка авторов, открытое программное обеспечение и коммерческое программное обеспечение, доступное для обучающихся бесплатно или за умеренную плату. Собственное программное обеспечение гУдается на персональном вебсайте. Ключевые темы и методы, представленные в этой книжке, включают: обработка данных и стандартизация; разработка и использование химических баз данных; структурирование путем описания молекул, текстовых строк и бинарнь формаций дескрипторов; конструирование разнообразных заготовок; анализ химических данных и их визуализация; моделирование связей строения и активности (QSA/QR); подходы к моделированию ансамблей, включая объединение, повышение энтропии, складывание и пространства подпространств случайных выборок; моделирование 3-мерных фармакофор и их профилирование с использованием методов анализа формы; связывание протеин-лиганд; реализовать алгоритмы на языке высокого уровня. Эта книжка является идеальным помощникам для продвинутых учеников и обладателей ученой степени в области кемоинформатики, биоинформатики, вычислительной химии, биологической химии, медицинской химии и биохимии. Также она является ценной практической платформой для медиков-химиков, научных исследователей и химиков-теоретического исследования, желающих расширить свои возможности применения кемоинформации.
Электронная Книга «Tutorials in Chemoinformatics» написана автором Группа авторов в году.
Минимальный возраст читателя: 0
Язык: Английский
ISBN: 9781119137979
Описание книги от Группа авторов
30 tutorials and more than 100 exercises in chemoinformatics, supported by online software and data sets Chemoinformatics is widely used in both academic and industrial chemical and biochemical research worldwide. Yet, until this unique guide, there were no books offering practical exercises in chemoinformatics methods. Tutorials in Chemoinformatics contains more than 100 exercises in 30 tutorials exploring key topics and methods in the field. It takes an applied approach to the subject with a strong emphasis on problem-solving and computational methodologies. Each tutorial is self-contained and contains exercises for students to work through using a variety of software packages. The majority of the tutorials are divided into three sections devoted to theoretical background, algorithm description and software applications, respectively, with the latter section providing step-by-step software instructions. Throughout, three types of software tools are used: in-house programs developed by the authors, open-source programs and commercial programs which are available for free or at a modest cost to academics. The in-house software and data sets are available on a dedicated companion website. Key topics and methods covered in Tutorials in Chemoinformatics include: Data curation and standardization Development and use of chemical databases Structure encoding by molecular descriptors, text strings and binary fingerprints The design of diverse and focused libraries Chemical data analysis and visualization Structure-property/activity modeling (QSAR/QSPR) Ensemble modeling approaches, including bagging, boosting, stacking and random subspaces 3D pharmacophores modeling and pharmacological profiling using shape analysis Protein-ligand docking Implementation of algorithms in a high-level programming language Tutorials in Chemoinformatics is an ideal supplementary text for advanced undergraduate and graduate courses in chemoinformatics, bioinformatics, computational chemistry, computational biology, medicinal chemistry and biochemistry. It is also a valuable working resource for medicinal chemists, academic researchers and industrial chemists looking to enhance their chemoinformatics skills.
