Фамилия Хныченко имеет корни в старинном русском обычае присваивания мирских имен детям с целью отвращения злых сил. Основой этой фамилии послужило мирское имя Хныч, которое восходит к глаголу «хныкать» - «тихо и жалобно плакать».
Вероятно, имя Хнычем присвоили плаксивому, беспокойному младенцу в надежде успокоить его и оберегать от негативных воздействий. На Руси существовал обычай давать детям имена, которые имели противоположное значение относительно ожиданий или желаний родителей. Это было сделано с надеждой отвести зло и не привлекать нежелательное внимание. Таким образом, родители, надеясь на здорового, спокойного и веселого мальчика, назвали его Хнычем.
Суффикс "-енко" в фамилии указывает на украино-белорусское происхождение. В прошлом, практика давать ребенку дополнительное мирское имя, которое не было связано с крещением, была распространена и поддерживалась до XVII века. Это привело к тому, что фамилии, образованные от мирских имен, стали значительной частью славянских фамилий.
Таким образом, происхождение фамилии Хныченко уходит корнями в старинный обычай присваивания мирских имен детям на Руси. Название Хныч, связанное с плачем и оберегающим значением, перешло в фамилию, которая до сих пор является распространенной в украино-белорусской культуре.