ну это обычное дело когда появляется это сообщение.
флешку одну и ту же вставляешь? в один и тот же usb? после установки флешки ты перезагружаешь ПК или нет? Если нет, как происходит завершение работы винды (может быть ты ее резетом завершаешь или тупо электричество вырубаешь из-за чего она так и не может нормально установиться ?
Перед тем как флешку достать делаешь отключение устройства (рядом с часиками значок) ?