Не понятен сам вопрос.
Возможно, ваша утилита TuneUP удалила важные ключи реестра, в результате этого возникают ошибки в работе.
Рекомендую использовать утилиту Wintools для чистки реестра и диска от ненужных файлов.
Дополнительно можно пользоваться программой деинсталлятором, которая при удалении программ подчищает пустые ключи реестра, например, Revo Uninstaller.