Я студент факультета информатики и интересуюсь теорией графов. Я искал наборы данных для мозговых сетей (структурных и функциональных) для анализа графов.
Я нашел наборы данных изображений мозга, такие как HCP и nilearn, но мне было интересно, есть ли наборы данных необработанных графов для работы. Было бы здорово, если бы эти мозговые сети были также помечены фенотипом или заболеванием, потому что я хочу выполнить графический анализ.
#нейронаука #мозг #данные
Если вы создадите (бесплатную) учетную запись по адресу: https://db.humanconnectome.org , я считаю, что ты сможешь найти коннектомы через здесь.
Однако загрузка файлов кажется немного затруднительной (и кажется, что они поставляются только в очень больших пакетах).
Другой, возможно, более простой метод, если вы просто хотите, чтобы с некоторыми простыми и легко доступными файлами можно было сразу работать:
https://neurodata.io/project/connectomes/
о котором вы можете прочитать подробнее в Эта статья.
Там вы можете просто скачать некоторые графики прямо в формате .graphml. Затем вы можете использовать их, например. питон с сетьx. Например, чтобы построить объект графика из файла Graphml, построить его график и получить матрицу смежности, вы просто напишете:
import networkx as nx
G = nx.read_graphml("/rhesus_brain_2.graphml")
M = nx.adjacency_matrix(G)
nx.draw(G, node_size = 10, width = 0.1, arrowsize = 2, pos = nx.spring_layout(G))
Это всего лишь простой пример, но я надеюсь, что он поможет. Казалось, что это именно то, что вам нужно: что-то сырое и простое, чтобы начать; и эти наборы данных иногда труднее всего найти.
(Я сам ищу более конкретные типы коннектомов; см. мой вопрос здесь. Если вдруг что-нибудь еще встретите, буду очень признателен, если сообщите мне.)
![[Udemy] [Даниил Волосатов] Веб-дизайнер - профессионал. Создание востребованных макетов (2019)](/assets/images/icons/forum2.png){kind=icon}
![[Udemy] Анимация на конструкторе (2020) [Animation Trainer]](/assets/images/icons/forum4.png){kind=icon}
![[rabotadoma2.ru] Тренинг](/assets/images/icons/forum3.png){kind=icon}
