Книга "Tag-based Next Generation Sequencing" описывает подходы, основанные на использовании маркеров (тэгов), которые изначально были разработаны для увеличения производительности капиллярного секвенирования. Впервые они были использованы для профилирования экспрессии генов. С развитием новых методов секвенирования следующего поколения, маркеры широко используются, поскольку их длина идеально соответствует короткой длине чтения в реакциях с высокой параллельностью секвенирования. Маркеры будут продолжать играть важную роль в жизни и биомедицинской науке, потому что для многих приложений длинные чтения часто не требуются для получения значимых данных. В то время как пересеквенирование генома и де-ново секвенирование будут извлекать пользу из более мощных методов секвенирования, аналитические приложения могут быть выполнены с помощью маркеров, где акцент смещается от 'мощности секвенирования' к лучшим средствам анализа данных и визуализации для обычных пользователей. Сегодня данные секвенирования следующего поколения требуют мощной биоинформатической экспертизы, которую необходимо превратить в инструменты анализа данных, удобные для использования. Цель этой книги - дать обзор недавно разработанных подходов на основе маркеров, а также средств их анализа данных, вместе с введением в методы секвенирования следующего поколения, протоколы и руководства пользователя, чтобы стать входной точкой для ученых в изучении подходов на основе маркеров для секвенирования следующего поколения.
Электронная Книга «Tag-based Next Generation Sequencing» написана автором Harbers Matthias в году.
Минимальный возраст читателя: 0
Язык: Английский
ISBN: 9783527644773
Описание книги от Harbers Matthias
Tag-based approaches were originally designed to increase the throughput of capillary sequencing, where concatemers of short sequences were first used in expression profiling. New Next Generation Sequencing methods largely extended the use of tag-based approaches as the tag lengths perfectly match with the short read length of highly parallel sequencing reactions. Tag-based approaches will maintain their important role in life and biomedical science, because longer read lengths are often not required to obtain meaningful data for many applications. Whereas genome re-sequencing and de novo sequencing will benefit from ever more powerful sequencing methods, analytical applications can be performed by tag-based approaches, where the focus shifts from 'sequencing power' to better means of data analysis and visualization for common users. Today Next Generation Sequence data require powerful bioinformatics expertise that has to be converted into easy-to-use data analysis tools. The book's intention is to give an overview on recently developed tag-based approaches along with means of their data analysis together with introductions to Next-Generation Sequencing Methods, protocols and user guides to be an entry for scientists to tag-based approaches for Next Generation Sequencing.
