Bioinformatics Algorithms (Ion Mandoiu).

Эта книга знакомит читателя с алгоритмическими методами решения проблем в области биоинформатики, включая приложения, которые проливают новый свет на молекулярную биологию.

В книге представлены алгоритмические методы в области биоинформатики с акцентом на их применение для решения новых задач в постгеномной молекулярной биологии. Начиная с обсуждения роли алгоритмов в образовании в области биоинформатики двадцать первого века, “Биоинформатика: алгоритмы” охватывает: общие алгоритмические методы, включая динамическое программирование, графовые методы, скрытые модели Маркова, быстрый преобразование Фурье, методы посева и приближенные алгоритмы. Алгоритмы и инструменты для анализа генома и последовательностей, включая формальные и приближенные модели кластеров генов, продвинутые алгоритмы для неперекрывающихся локальных соответствий и мозаики генома, многоплексный выбор праймеров для ПЦР и поиск мотивов последовательности/сети Микрочип дизайна и анализа, включая алгоритмы физического дизайна микрочипа, восполнения отсутствующих значений и мета-анализа данных экспрессии генов. Проблемы алгоритмизации, возникающие при анализе генетических вариаций в человеческой популяции, включая вычислительные методы.